Frontières entre terre et mer, les estuaires, lagunes et deltas voient s’imbriquer quotidiennement les eaux douces et les eaux marines. Les grands estuaires de France (Seine, Loire et Gironde) et le delta du Rhône ne sont que quelques exemples des milieux dits “de transition” qui occupent notre littoral.

Les usagers des plans d’eau (pêcheurs, chasseurs, entreprises hydro-électriques, etc.) sont les premiers à pouvoir contribuer à leur bon état. Toutefois, cela ne peut se faire sans le concours de l’ensemble des acteurs du bassin versant. La gestion globale de l’eau et des milieux aquatiques, complétée par une réglementation spécifique, permet la préservation des milieux. Malgré cela, le recours à des actions de restauration est parfois nécessaire.

Un plan d’eau exempt de substances toxiques et accueillant une biodiversité riche et variée est considéré en bon état. L’évaluation de l’état chimique et de l’état écologique des plans d’eau est réalisée grâce à la surveillance régulière de plusieurs centaines de paramètres.

Les lacs et étangs sont des écosystèmes dynamiques qui communiquent avec leur bassin versant. En constante évolution, certains plans d’eau sont destinés à se combler à long terme. Ce sont des milieux riches en habitats naturels pour la faune et la flore : ils hébergent de nombreuses espèces aquatiques, bien au delà des seuls poissons.

Les plans d’eau sont des étendues d’eau douce plus ou moins profondes, naturelles ou artificielles. Malgré leur apparence statique, l’eau qu’ils contiennent s’écoule lentement, pour rejoindre d’autres milieux aquatiques plus en aval. Ces écosystèmes dits lacustres sont présents sur l’ensemble du territoire.

Si le riverain d’une rivière est le premier attentif à son état, tous les acteurs du bassin versant sont concernés. C’est à cette échelle que doit s’organiser la gestion globale de l’eau et des milieux aquatiques. Complétée par une réglementation spécifique, elle permet la préservation des milieux. Malgré cela, le recours à des actions de restauration est parfois nécessaire.

Une rivière exempte de substances toxiques et accueillant une biodiversité riche et variée est considérée en bon état. L’évaluation de l’état chimique et de l’état écologique des cours d’eau est réalisée grâce à la surveillance régulière de plusieurs centaines de paramètres.

L’observation de la hauteur d’eau permet d'estimer le débit des rivières. Cette surveillance permet de mieux comprendre le fonctionnement du cours d’eau et apporte les éléments de connaissance nécessaires à la gestion des risques d'inondation ou de sécheresse.

En apparence stable dans son lit mineur, le cours d’eau est en réalité un écosystème dynamique qui se transforme petit à petit au fil des saisons. Sa diversité de forme et de taille en fait un milieu riche d’habitats naturels variés. Les espèces aquatiques qu’il abrite sont une biodiversité à protéger.

Les cours d'eau acheminent l'eau depuis une source jusqu’au milieu marin. Ils s’écoulent de l'amont vers l'aval de leur bassin versant. Les plus connus sont les fleuves, qui se jettent dans la mer, mais la France est parcourue par de très nombreux autres cours d'eau.